水由進水口進入過濾器，首先經過粗濾芯組件濾掉較大顆粒的雜質，然后到達細濾網，通過細濾網濾除細小顆粒的雜質后，清水由出水口排出。
在過濾過程中，細濾網的內層雜質逐漸堆積，它的內外兩側就形成了一個壓差。當這個壓差達到預設值時，將開始自動清洗過程：排污閥打開，主管組件的水力馬達室和水力缸釋放壓力并將水排出；水力馬達室及吸污管內的壓力大幅下降，由于負壓作用，通過吸嘴吸取細濾網內壁的污物，由水力馬達流入水力馬達室，由排污閥排出，形成一個吸污過程。當水流經水力馬達時，帶動吸污管進行旋轉，由水力缸活塞帶動吸污管作軸向運動，吸污器組件通過軸向運動與旋轉運動的結合將整個濾網內表面完全清洗干凈。整個清洗過程將持續數十秒。排污閥在清洗結束時關閉，增加的水壓會使水力缸活塞回到其初始位置，過濾器開始準備下一個沖洗周期。在清洗過程中，過濾機正常的過濾工作不間斷。
反沖洗能自動進行的原理：前面說過，反沖洗是靠液壓閥打開和液壓缸活塞的動作來實現的，而這些都是通過反沖洗控制器來控制的。反沖洗控制器根據從過濾器進、出口傳過來的壓差值能準確控制液壓閥和液壓缸，而控制器的動力來自于管線自身的壓力。
自清洗過濾器特性：進行反沖洗時不間斷供水，整個反沖洗是以吸嘴凈濾網每一點這樣的方式實現的。反沖洗時只是吸嘴與細濾網之間很小的局域壓力發生變化，而收集器與液壓缸的動作也不影響正常的供水。同時，在進行反沖洗時所消耗的水量很少，以流量為300m3/h．的過濾器為例：其反沖洗流量為35—40m3/h，反沖洗時間為7—15秒，反沖洗水量為80—160L 

1.自清洗過濾器只能按銘牌上面所標示的額定電壓/頻率使用。
2.每隔一段時間就應對過濾器進行保養。清洗及保養之前，請務必將自清洗過濾器電源斷開。
3.請確保電線插頭不要在清洗是弄濕否則在重新接通電源前必須將插頭擦干。
4.不能用濕手拔掉電源線插頭。
5.自清洗過濾器只限于室內水族箱中使用。
6.如果過濾器損壞，特別是電源線損壞時不能使用。
7.請確保自清洗過濾器在正確的水位中工作，過濾器不能在無水情況下使用。
8.請勿私自拆解或維修，以避免造成危險或對機體造成損壞，維修應由專業人士